RT-PCR检测肿瘤转移指标试剂盒使用说明书
(CK19,CK20,CEA,AFPmRNA)
一.
试剂盒组成(20人份)
1. GIF变性液
2. 2M NaOAC(ph值4.0)
3. MMLV逆转录酶200u/ul
4. 逆转录反应体系:(RT reaction buffer)
5. 随机引物:(random primer)
6. PCR反应体系:(PCR reaction buffer)
7. Taq DNA聚合酶:1u/ul
8. 引物P1(上游),P2(下游)
9. 去Rnase水
二.
方法
1. 提取总RNA
1) 100mg标本剪碎后加500ul GIF变性液,在匀浆器内匀浆(若为抗凝血标本,可用淋巴细胞分离液分离出单个核细胞后,直接加500ul GIF变性液),加入50ul 2MnaOAc、500ul水饱和酚,100ul氯仿,每步均需混匀。旋涡震荡器混匀10秒钟,冰浴5-15分钟。
2) 4℃10000g离心10分钟后,小心吸取上清移入新effendorf管中,切忌吸入蛋白,加入等体积的异丙醇,-20℃放置1h。
3) 4℃12000g离心10分钟后,弃上清;沉淀用100ulGIT变性液重溶,加入等体积乙丙醇混匀,-20℃1h。
4) 4℃12000g离心10分钟后,弃上清;用75%乙醇洗一遍。至此可加入1ml无水乙醇于-70℃保存备用,也可直接凉干,溶于适量无Rnase的去离子水中。
5)
用紫外分光光度计测出A260及A280的值,计算所提总RNA的含量。
2. 逆转录(RT)反应
于DEPC处理的0.5mlEppendorf管中,按表1加入所示试剂。
表1
逆转录(RT)反应体系
试剂名称
用量
总RNA
约1ug
MMLV
1ul
随机引物
2ul
逆转录反应体系
7ul
去Rnase水
补至20ul
快速离心混匀;37℃放置1h,95℃10分钟灭活MMLV。快速离心使蒸汽沉于管底。
3.
PCR反应
在上述20ul
RT产物0.5ml Eppendorf管中继续加入表2所示试剂。
表2
PCR反应体系
试剂名称
用量
RT反应产物
10-20ul
PCR反应体系
19ul
上游引物
P1
1ul
下游引物
P2
1ul
超净水
补至100ul(含2ulTaqDNA聚合酶)
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快速离心混匀,
95℃5分钟。离心使蒸汽沉于管底。加入2ul(1u/ul)Taq聚合酶,快速离心混匀,加入100ul液体石蜡。
循环条件:94℃1分钟,58℃1分钟,72℃1分钟。循环35次,末次延长7分钟,电泳鉴定。
4.
定量分析
可用凝胶成像分析系统测出阳性标志物和β-actin的表达强度,按下表计算相对系数:
相对系数=标志物表达强度/β-actin表达强度
根据相对系数可作直方图或作统计学处理。
三.
注意事项
1. 提取总RNA应在严格的无Rnase环境下进行,避免RNA降解。
2. 应使用20ul以下移液器并配置相应的Tip加样,保证加样量的准确。
3. 应确保程序中所提的冰浴环境和4℃环境,保证反应温度的准确性。
注: 该中文说明书仅作参考!